El Instituto Multidisciplinario de Historia y Ciencias Humanas (IMHICIHU) es una Unidad Ejecutora creada por el CONICET en el año 2000, con el objetivo de congregar grupos de investigación de reconocida trayectoria y sólida formación profesional que actuaron de manera independiente desde 1990 hasta esa fecha. Se trata de los antiguos Programas de Estudios Prehistóricos (PREP), Investigaciones Medievales (PRIMED), de Estudios Egiptológicos (PREDE) y de Geografía Humana (PRIGEO). En octubre de 2004, se sumó el Programa Atlas Territorial de la República Argentina (PROATLAS). Por último, en mayo de 2023, se incorporó el Laboratorio de Documentación e Investigación en Lingüística y Antropología (DILA), creado en 2007 a partir de un Convenio de Cooperación Científica y Tecnológica entre el CONICET y el Instituto Max Planck (MPI) para Psicolingüística (Nijmegen, Holanda). De esta forma, se completa la estructura del IMHICIHU y se nuclean las distintas líneas de investigación consagradas a diversas disciplinas de las ciencias sociales y humanidades.
Tras la creación del Instituto, los programas PREP, PRIMED, PREDE, PRIGEO y PROATLAS adoptaron una estructura organizativa de departamentos; más tarde se transformaron en áreas de investigación con una coordinación que atiende a los asuntos específicos del área. Por tal razón, esta UE tiene una conformación especial, amalgamando y, a la vez, dando autonomía a sus distintas partes –en función, precisamente, de la disparidad temática de las investigaciones que se llevan a cabo en ellas–. Este carácter heterogéneo e integrado fue uno de los motivos por los que fuera elegido para recibir al Laboratorio de Documentación e Investigación en Lingüística y Antropología al momento de separarse de su dependencia inicial, el CAICyT. En la actualidad, las áreas de investigación son cuatro: Arqueología y Prehistoria, Historia Antigua y Medieval, Lingüística y Antropología e Investigaciones Geográficas.